Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3kQ5GIG6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms