Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Spire1Q52KF3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spire1Q52KF3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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