Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms