Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Khdc1cQ4KL78 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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