Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2al1nQ497L1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1nQ497L1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms