Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms