Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms