Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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