Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp30Q3UN04 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp30Q3UN04 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp30Q3UN04 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp30Q3UN04 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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