Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms