Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Usp19Q3UJD6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp19Q3UJD6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Usp19Q3UJD6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Usp19Q3UJD6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Usp19Q3UJD6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp19Q3UJD6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp19Q3UJD6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp19Q3UJD6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp19Q3UJD6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp19Q3UJD6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms