Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nom1Q3UFM5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nom1Q3UFM5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nom1Q3UFM5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nom1Q3UFM5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nom1Q3UFM5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nom1Q3UFM5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms