Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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Ssbp4Q3U4B1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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