Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Ulk3Q3U3Q1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ulk3Q3U3Q1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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