Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms