Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms