Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim43aQ3TL54 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms