Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trappc13Q3TIR1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trappc13Q3TIR1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trappc13Q3TIR1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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