Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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