Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim71Q1PSW8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms