Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam83bQ0VBM2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms