Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms