Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms