Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdf3Q07104 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gdf3Q07104 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf3Q07104 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms