Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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