Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms