Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms