Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GscQ02591 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GscQ02591 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms