Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms