Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms