Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms