Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms