Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb4P99026 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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