Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cds1P98191 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cds1P98191 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms