Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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