Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Irx1P81068 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Irx1P81068 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms