Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx3P81067 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx3P81067 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx3P81067 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms