Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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SeboxP70368 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SeboxP70368 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms