Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Msx3P70354 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Msx3P70354 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Msx3P70354 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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