Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gfi1P70338 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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