Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb13P70321 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms