Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pkn1P70268 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms