Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chl1P70232 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms