Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhbdl3P58873 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms