Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms