Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CckbrP56481 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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