Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cox7bP56393 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms