Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Aqp4P55088 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Aqp4P55088 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms