Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nub1P54729 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nub1P54729 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nub1P54729 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nub1P54729 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nub1P54729 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Nub1P54729 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nub1P54729 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Nub1P54729 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Nub1P54729 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nub1P54729 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nub1P54729 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nub1P54729 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nub1P54729 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nub1P54729 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nub1P54729 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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