Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23aP54726 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms